Em geral, uma trufa é o fruto de uma espécie subterrânea (algo que vive no subsolo) de fungos durante uma certa fase do ciclo de vida do fungo. As trufas mágicas, especificamente, são a esclerócio de Psilocybin contendo cogumelos mas não são cogumelos em si, são massas compactadas de micélio, servindo como reserva para todo o fungo.
O seu nome científico é esclerócio (plural). Apesar de alguma desinformação em contrário, as trufas mágicas contêm de facto psilocibina tal como os seus irmãos cogumelos acima do solo. Normalmente os esclerócios são formados quando as condições de crescimento dos cogumelos frutíferos não são as melhores, em vez disso o fungo cria inteligentemente uma reserva de água e comida sob a forma de trufa que pode prosperar no subsolo até que o ambiente se mude para melhor.
Das mais de 200 espécies de cogumelos psilocibinos Apenas alguns, como Psilocybe Tampanensis, Mexicana ou Atlantis, podem realmente formar trufas próprias.