Substrát je jakékoliv prostředí, ve kterém něco roste, jako je květináč s půdou nebo hromada dřevěných štěpků, v případě hub se obvykle nacházejí na čemkoliv, co hnije, odumírající kořeny trávy nebo padlý kmen stromu jsou pro houby ideálním domovem, protože rozklad biologické hmoty je typickým způsobem, jak houby přežívají.
Konkrétně u magických hub jsou nejoblíbenějším substrátem piliny, dřevěné štěpky, polena nebo dokonce zrna.
Dokud je tam nějaká hniloba a trochu kyslíku, houby obvykle prospívají, vcelkuCelkem jsou substráty z obilí a rýže.