Een substraat is een medium waarin iets groeit, zoals een pot aarde of een stapel houtsnippers, in het geval van paddestoelen worden ze meestal gevonden op alles wat aan het rotten is, wat afstervende graswortels of een omgevallen boomstam biedt de perfecte thuis voor een schimmel, aangezien de afbraak van biologisch materiaal typisch is hoe paddestoelen overleven.
Specifiek voor paddo's bestaan de substraten waaraan zij de voorkeur geven uit zaagsel, houtsnippers, boomstammen of zelfs granen.
Zolang er wat rot is en een beetje zuurstof, zal een paddestoel meestal kunnen gedijen, bij Wholecelium zijn de substraten gemaakt van graan en rijst.